Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRACR2AQ9BSW2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRACR2AQ9BSW2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms