Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms