Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms