Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3R4Q99570 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms