Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPR78Q96P69 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms