Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms