Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
C2orf48Q96LS8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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