Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTHRC1Q96CG8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTHRC1Q96CG8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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