Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM72Q6ZMU5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms