Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms