Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms