Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGD3Q5JSP0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms