Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms