Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ACSM3Q53FZ2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ACSM3Q53FZ2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACSM3Q53FZ2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACSM3Q53FZ2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACSM3Q53FZ2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ACSM3Q53FZ2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ACSM3Q53FZ2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACSM3Q53FZ2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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