Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A12Q504Y0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms