Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC27Q2M243 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms