Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Q1T7F1 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms