Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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COL24A1Q17RW2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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COL24A1Q17RW2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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COL24A1Q17RW2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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COL24A1Q17RW2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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