Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms