Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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HIST2H2BEQ16778 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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HIST2H2BEQ16778 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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HIST2H2BEQ16778 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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HIST2H2BEQ16778 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HIST2H2BEQ16778 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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