Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SHBQ15464 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SHBQ15464 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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