Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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