Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAM2Q15035 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms