Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3AQ14156 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms