Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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TUBA3CQ13748 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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