Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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