Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HDAC1Q13547 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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