Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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PRDM2Q13029 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
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