Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STX4Q12846 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
STX4Q12846 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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STX4Q12846 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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