Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PUDPQ08623 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms