Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCN1BQ07699 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms