Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms