Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NRG1Q02297 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms