Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HOXC5Q00444 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC5Q00444 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms