Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GNB1P62873 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GNB1P62873 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GNB1P62873 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms