Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HERVK_113P62684 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms