Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVPABLB-1P60509 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVPABLB-1P60509 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms