Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC3P51654 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC3P51654 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC3P51654 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC3P51654 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC3P51654 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC3P51654 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC3P51654 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC3P51654 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC3P51654 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms