Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms