Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FDFT1P37268 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms