Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms