Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms