Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA1P25786 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA1P25786 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms