Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTSSP25774 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSSP25774 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSSP25774 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTSSP25774 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTSSP25774 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSSP25774 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSSP25774 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSSP25774 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSSP25774 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSSP25774 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms