Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

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Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD247P20963 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD247P20963 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD247P20963 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD247P20963 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD247P20963 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD247P20963 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD247P20963 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD247P20963 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD247P20963 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms