Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNA2P20248 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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