Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNNI3P19429 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms