Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA2P17301 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms