Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms