Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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PKHD1P08F94 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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PKHD1P08F94 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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